Nachdem das System installiert wurde, ist es notwendig, es bootbar zu machen. Dies kann zum Einen über "Boot-Disketten" oder über den MBR der Festplatte erfolgen.  Ein Bootmanager erlaubt die Auswahl zwischen verschiedenen Betriebssystemen und lädt die jeweiligen "Kernel".

Unter Linux gibt es aktuell zwei bekannte Bootmanager: lilo und grub. Während Lilo direkt die Kernel von den phyikalischen Sektoren der Festplatte lädt, handelt es sich bei grub um ein "Mini-Betriebssystem". Dadurch erlaubt grub es auch, beim Start verschiedene Einstellungen zu ändern oder direkt auf Festplatten zuzugreifen.